1.课题组组长简介
孙亮，山东第一医科大学医学人工智能与大数据学院教授，核酸大数据与智慧医学实验室课题组长（PI），山东省泰山学者青年专家，山东省教育厅青创团队引育计划“生物医药大数据创新研究团队”负责人，山东省卫生健康科创团队“生物医学大数据研究领军创新团队”，负责人。主要从事多组学数据的生物信息学研究、癌症等重大疾病的复杂调控机制研究、基于医疗大数据的临床决策系统研究。发表SCI总引用次数近2000次，2024年获批北京市自然科学一等奖（排名第四），目前共主持国家自然科学基金3项，国家重点研发计划课题1项，省内企业500万元的重大横向课题1项，省内事业单位横向课题1项。
2.课题组研究方向
● 方向一：多组学数据的生物信息学分析
● 方向二：癌症等重大疾病复杂调控机制研究
● 方向三：基于医疗大数据的临床决策支持研究
3.部分代表性论文(*第一或通讯作者)
[1]Sun, L.*, Luo, H., Bu, D., Zhao, G., Yu, K., Zhang, C., ... & Zhao, Y. (2013). Utilizing sequence intrinsic composition to classify protein-coding and long non-coding transcripts. Nucleic acids research, 41(17), e166-e166.(SCI, IF:17)
● 他引次数：1600+次，生物学、基因组学高被引论文。
● 生物学中科院一区，TOP期刊。
[2]Fan L, Zhou X, Li M, Gao A, Yu H, Tian H, Liao L, Xu L, Sun L*. CICADA: a circRNA effort toward the ghost proteome. Nucleic Acids Res. 2025 Jan 7;53(1):gkae1179. doi: 10.1093/nar/gkae1179. PMID: 39711481; PMCID: PMC11724281.(SCI,IF：16.6)
[3]Zhou X, Qin Y, Li J, Fan L, Zhang S, Zhang B, Wu L, Gao A, Yang Y, Lv X, Guo B, Sun L*. LncPepAtlas: a comprehensive resource for exploring the translational landscape of long non-coding RNAs. Nucleic Acids Res. 2025 Jan 6;53(D1):D468-D476. doi: 10.1093/nar/gkae905. PMID: 39435995; PMCID: PMC11701525. (SCI,IF：16.6)
[4]Guo, J. C., Fang, S. S., Wu, Y., Zhang, J. H., Chen, Y., Liu, J., ... Sun, L.* (2019). CNIT: a fast and accurate web tool for identifying protein-coding and long non-coding transcripts based on intrinsic sequence composition. Nucleic acids research, 47(W1), W516-W522.(SCI, IF: 17)
● 他引次数：89次。
● 生物学中科院一区，TOP期刊。
[5] Sun, L.*, Luo, H., Liao, Q., Bu, D., Zhao, G., Liu, C., ... & Zhao, Y. (2013). Systematic study of human long intergenic non-coding RNAs and their impact on cancer. Science China Life Sciences, 56(4), 324-334.1.(SCI, IF:11)
● 他引次数：33次。
● 生物学中科院一区，TOP期刊。
[6]Chong Geng, J. L., Bingzhou Guo, Kailin Liu, Pengfei Gong, Bao Wang, Qiang Wan, Liang Sun*, Jiajun Zhao*, Yongfeng Song*. (2024). High Lymphocyte Signature Genes Expression in Parathyroid Endocrine Cells and its Downregulation Linked to Tumorigenesis. EBioMedicine.102, 105053. (SCI, IF:11.1).
● 医学中科院一区
[7]Cheng, Y., Sun, C., Chang, Y., Wu, J., Zhang, Z., Liu, Y., Ge, S., Li, Z., Li, X., Sun, L*., Zang, D*. (2023). Photoelectrochemical biosensor based on SiW12@CdS quantum(SCI, IF:5.89).
[8]Liu, W., Dong, R., Gao, S., Shan, X., Li, M., Yu, Z., & Sun, L. (2022). Assessing the Prognostic Capability of Immune-Related Gene Scoring Systems in Lung Adenocarcinoma. Journal of oncology, 2022, 2151396.(SCI, IF:4.5)
[9]Su X, Yu Z, Zhang Y, Chen J, Wei L, Sun L. Construction and Analysis of the Dysregulated ceRNA Network and Identification of Risk Long Noncoding RNAs in Breast Cancer. Front Genet. 2021 Jun 4;12:664393. (SCI, IF:4.599)
[10]Hong, S., Hu, S., Kang, Z., Liu, Z., Yang, W., Zhang, Y., Sun, L.* & Chen, L*. (2020). Identification of functional lncRNAs based on competing endogenous RNA network in osteoblast differentiation. Journal of Cellular Physiology, 235(3), 2232-2244.(SCI, IF:5.6)
[11]Fang, S. S., Guo, J. C., Zhang, J. H., Liu, J. N., Hong, S., Yu, B., Sun, L.* & Zhao, Y.* (2020). A P53‐related microRNA model for predicting the prognosis of hepatocellular carcinoma patients. Journal of Cellular Physiology , 235 (4), 3569-3578.(SCI, IF:5.6)
[12] Song, X.*, Sun, L.*, Luo, H., Ma, Q., Zhao, Y., & Pei, D. (2016). Genome-wide identification and characterization of long non-coding RNAs from mulberry (Morus notabilis) RNA-seq Data. Genes, 7(3), 11.1.(SCI, IF:4.096)
4.研究成果展示
LncPepAtlas：探索长非编码RNA翻译图谱的综合资源
CICADA：经济有效揭示circRNA编码“幽灵蛋白组”的创新算法
5.科研项目
国家自然科学基金国际（地区）合作交流项目（项目号32211530422，3万元，孙亮）
国家重点研发计划子课题（项目号2024YFA1210903，80万元，孙亮，任务负责人）
山东省自然科学基金青年项目（项目号ZR2023QC270，15万元，巩鹏飞）
中国博士后科学基金第72批面上资助（项目号2022M721989，8万元，巩鹏飞）
山东省自然科学基金青年项目（项目号ZR2024QC366，8万元，李江雪）
6.人才培养
连续5年开设本科生公选课《医学人工智能（科学）》，累计选课学生近400人；开设研究生课程《医学人工智能与大数据》。先后指导博士后4人、博士研究生2人；指导的4名硕士研究生均继续攻读本校博士学位，另有1名硕士研究生考取山东大学博士；本科生指导方面，已指导本科生7人，其中指导学生获软件著作权登记1项、大学生创新创业训练计划项目国赛立项1项。
7.团队建设
团队合照
团队成员
8.长期招聘
(1)招聘博士后：研究方向包括但不限于计算机类、生物信息学、生物医工类。
(2)招聘研究生或访问学生:对生物信息学与AI交叉研究有浓厚兴趣；能保证连续学习时间不少于1年；有相关研究经历者优先。
(3)有意向者可发简历到邮箱：sunliang@sdfmu.edu.cn。
