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孙亮

教授、博士生导师

核酸大数据与智慧医学实验室(PI)


  山东第一医科大学

E-mail:sunliang@sdfmu.edu.cn

电 话:18601987150


个人简介

孙亮,山东第一医科大学医学人工智能与大数据学院教授,核酸大数据与智慧医学实验室课题组长(PI),山东省泰山学者青年专家,山东省教育厅青创团队引育计划“生物医药大数据创新研究团队”负责人,山东省卫生健康科创团队“生物医学大数据研究领军创新团队”,负责人。主要从事多组学数据的生物信息学研究、癌症等重大疾病的复杂调控机制研究、基于医疗大数据的临床决策系统研究发表SCI总引用次数近2000次,2024年获批北京市自然科学一等奖(排名第四),目前共主持国家自然科学基金3项,国家重点研发计划课题1项,省内企业500万元的重大横向课题一项,省内事业单位横向课题1项。


人才培养

连续5年开设本科生公选课《医学人工智能(科学)》,累计选课学生近400人;开设研究生课程《医学人工智能与大数据》。先后指导博士后3人、博士研究生2人指导的4名硕士研究生均继续攻读本校博士学位,另有1名硕士研究生考取山东大学博士本科生指导方面,已指导本科生7人,其中指导学生获软件著作权登记1项、大学生创新创业训练计划项目国赛立项1项。


教育经历

时间

单位

专业

学位

2000年9月-2004年7月

吉林大学

计算机科学与技术专业

学士

2005年9月-2007年7月

吉林大学

软件工程与理论

硕士

2008年7月-2013年12月

吉林大学

软件工程与理论/生物信息

博士


工作经历

时间

单位

岗位

2014年12月-2018年10月

中国科学院计算技术研究所

博士后

2018年10月-2021年1月

中国科学院计算技术研究所

助理研究员

2021年1月-至今

山东第一医科大学

教授


科研项目

1、国家重点研发计划“生物医用材料研发与组织器官修复替代”重点专项

课题名称:基于大数据的人工晶状体精准设计及数据库的建立

    间:2017.7 - 2020.12

参与身份:课题负责人

项目经费:67万

2、长链非编码RNA中的短肽序列鉴定与特征研究

项目类型:国家自然科学基金面上项目

    间:2020.01 - 2023.12

参与身份:项目负责人

项目经费:56万

3、基于RNA绑定蛋白特异性识别序列的人类长非编码RNA分类研究

项目类型:国家自然科学基金青年基金

    间:2016.01 - 2019.01(已结题)

参与身份:项目负责人

项目经费:20万

4、肥胖相关的交感神经与免疫机制研究

项目类型:国家自然科学基金国际(地区)合作交流项目

    间:2022.11 - 2024.04(已结题)

参与身份:项目负责人

项目经费:3万

5、山东省高等学校青年创新团队人才引育计划

项目来源:山东省教育厅

项目名称:生物医学大数据研究创新团队

项目经费:200万

    间:2022.01 - 2025.1

参与身份:团队负责人

6、山东省科技型中小企业创新能力提升工程

项目名称:基于纳米孔测序的头颈肿瘤标志物筛选及自动化检测

执行时间:2022.8 - 2024.7

项目经费:24万元

参与身份:高校方负责人

7、济南市科技局“新高校20条”扶持创业项目

项目来源:济南市科技局

项目类型:创业扶持计划

项目经费:30万元

    间:2021.12 - 2024.12

参与身份:项目负责人

8、联合人才培养合作项目

项目来源:山东省临床公共卫生中心

项目类型横向课题

    间:2022.01 - 2025.1

项目经费:220万

参与身份:项目负责人

9、基于人工智能技术的药物测算平台

项目类型横向课题

    间:2024.11 - 2029.12

项目经费:500

参与身份:项目负责人

10、国家重点研发计划子课题

课题名称:储能纳米材料的环境健康风险评估和安全评价预测


时间:2024.12 - 2029.11

参与身份:任务负责人

项目经费:80


学术任职及荣誉称号

奖项

奖励名称及等级

获奖时间

本人位次

北京市自然科学奖一等奖

长链非编码基因系统发现及分子特性和功能的理论研究

2024年

第4位/共5位

泰山学者青年专家

泰山学者青年专家

2022年

第1位

校级优秀教师

山东第一医科大学优秀教师

2023年

第1位


2017年,进入国家科技部专家库

2021年,济南市槐荫区青年领军人才

2021年,济南市槐荫区产业领军人才

2022年,国家健康医疗大数据中心(北方)建设发展专家咨询委员会信息标准工作委员会 委员

2022年,山东省泰山学者青年专家

国家自然科学基金委通讯评审专家

浙江省基金委项目评审专家

广东省基础与应用基础研究项目评审专家

山东省自然科学基金委通讯评审专家


部分代表性论文 (*第一或通讯作者)

[1]Sun, L.*, Luo, H., Bu, D., Zhao, G., Yu, K., Zhang, C., ... & Zhao, Y. (2013). Utilizing sequence intrinsic composition to classify protein-coding and long non-coding transcripts. Nucleic acids research, 41(17), e166-e166.(SCI, IF:17)

● 他引次数:1600+次,生物学、基因组学高被引论文。

● 生物学中科院一区,TOP期刊。

[2]Fan L, Zhou X, Li M, Gao A, Yu H, Tian H, Liao L, Xu L, Sun L*. CICADA: a circRNA effort toward the ghost proteome. Nucleic Acids Res. 2025 Jan 7;53(1):gkae1179. doi: 10.1093/nar/gkae1179. PMID: 39711481; PMCID: PMC11724281.(SCI,IF:16.6)

[3]Zhou X, Qin Y, Li J, Fan L, Zhang S, Zhang B, Wu L, Gao A, Yang Y, Lv X, Guo B, Sun L*. LncPepAtlas: a comprehensive resource for exploring the translational landscape of long non-coding RNAs. Nucleic Acids Res. 2025 Jan 6;53(D1):D468-D476. doi: 10.1093/nar/gkae905. PMID: 39435995; PMCID: PMC11701525. (SCI,IF:16.6)

[4]Guo, J. C., Fang, S. S., Wu, Y., Zhang, J. H., Chen, Y., Liu, J., ...  Sun, L.* (2019). CNIT: a fast and accurate web tool for identifying protein-coding and long non-coding transcripts based on intrinsic sequence composition. Nucleic acids research, 47(W1), W516-W522.(SCI, IF: 17)

● 他引次数:89次。

● 生物学中科院一区,TOP期刊。

[5] Sun, L.*, Luo, H., Liao, Q., Bu, D., Zhao, G., Liu, C., ... & Zhao, Y. (2013). Systematic study of human long intergenic non-coding RNAs and their impact on cancer. Science China Life Sciences, 56(4), 324-334.1.(SCI, IF:11)

● 他引次数:33次

● 生物学中科院一区,TOP期刊。

[6]Chong Geng, J. L., Bingzhou Guo, Kailin Liu, Pengfei Gong, Bao Wang, Qiang Wan, Liang Sun*, Jiajun Zhao*, Yongfeng Song*. (2024). High Lymphocyte Signature Genes Expression in Parathyroid Endocrine Cells and its Downregulation Linked to Tumorigenesis. EBioMedicine.102, 105053. (SCI, IF:11.1).

● 医学中科院一区

[7]Cheng, Y., Sun, C., Chang, Y., Wu, J., Zhang, Z., Liu, Y., Ge, S., Li, Z., Li, X., Sun, L*., Zang, D*. (2023). Photoelectrochemical biosensor based on SiW12@CdS quantum(SCI, IF:5.89).

[8]Liu, W., Dong, R., Gao, S., Shan, X., Li, M., Yu, Z., & Sun, L. (2022). Assessing the Prognostic Capability of Immune-Related Gene Scoring Systems in Lung Adenocarcinoma. Journal of oncology, 2022, 2151396.(SCI, IF:4.5)

[9]Su X, Yu Z, Zhang Y, Chen J, Wei L, Sun L. Construction and Analysis of the Dysregulated ceRNA Network and Identification of Risk Long Noncoding RNAs in Breast Cancer. Front Genet. 2021 Jun 4;12:664393. (SCI, IF:4.599)

[10]Hong, S., Hu, S., Kang, Z., Liu, Z., Yang, W., Zhang, Y., Sun, L.* & Chen, L*. (2020). Identification of functional lncRNAs based on competing endogenous RNA network in osteoblast differentiation. Journal of Cellular Physiology, 235(3), 2232-2244.(SCI, IF:5.6)

[11]Fang, S. S., Guo, J. C., Zhang, J. H., Liu, J. N., Hong, S., Yu, B., Sun, L.* & Zhao, Y.* (2020). A P53‐related microRNA model for predicting the prognosis of hepatocellular carcinoma patients. Journal of Cellular Physiology , 235 (4), 3569-3578.(SCI, IF:5.6)

[12] Song, X.*, Sun, L.*, Luo, H., Ma, Q., Zhao, Y., & Pei, D. (2016). Genome-wide identification and characterization of long non-coding RNAs from mulberry (Morus notabilis) RNA-seq Data. Genes, 7(3), 11.1.(SCI, IF:4.096)


专利

1、“一种区分蛋白编码基因和非编码基因的方法及系统”

授权公告号:CN103218543A

授权公告日:2016.4.13

发明(设计)人:赵屹、孙亮、罗海涛等

2、“一种环状RNA编码潜能的预测方法和系统”

授权公告号:CN 116364170 B

授权公告日:2024.6.7

发明(设计)人:孙亮、范丽媛、李冕、周新源

3、“多肽circ1946-109aa作为食管鳞癌预后标志物的应用”

授权公告号:CN 116621946 B

授权公告日:2024.2.20

发明(设计)人:范丽媛、田辉、孙亮、李冕、徐晓英


招生招聘

实验室每年招收硕士研究生2名、博士研究生1名,常年招聘优秀博士后(详见:https://mp.weixin.qq.com/s/T-3Rpitsje8orZCNXKSTEw),待遇从优,欢迎优秀青年才俊加入。


团队名称:核酸大数据与智慧医学实验室

现有团队成员13人,其中博士后2人博士研究生2人硕士研究生5人本科生4人。

团队照片